Spolek pro rozvoj Liboce protestuje proti výstavbě železniční trati do Ruzyně. Půjde prý spíše o povrchnové metro, spolek žádá, aby zde byla trať zahloubená.
Podle spolku vznikne na území Liboce a částečně na území Ruzyně „železniční dálnice“ či spíše odkryté „povrchové metro“, které nemá v Praze obdoby. Ačkoliv navazující úsek Dejvice – Veleslavín hodlá Správa železnic zahloubit, neboť „povrchové vedení ve stávající stopě by mělo drastické dopady na okolní zástavbu“ (citace z webu Správy železnice), všechna negativa povrchového vedení mají být v úseku Veleslavín – Ruzyně zachována.
Stanice Praha-Liboc měla být původně umístěna podél ulic Naardenská a U Kolejí. Nově je zastávka navržena na zcela jiném místě, které je však v bezprostřední blízkosti bytových domů v ulici Pavlovská a Ruzyňská. Součástí stavby modernizace dráhy je i trakční napájecí stanice a transformovna 110/22 kV PREdistribuce v bezprostřední blízkosti Libockého rybníka, s novým stožárem velmi vysokého napětí přímo u rybníka.
Nebyl posouzen „přechodný stav“ zahrnující provoz motorových vlaků. Důsledkem je, že v rámci „přechodného stavu“, jehož délku lze odhadnout na 10 – 15 let, stoupne na úseku Veleslavín - Ruzyně zátěž z provozu motorových vlaků, a to o 295 % oproti dnešku v denních hodinách a o 405% oproti dnešku v nočních hodinách. Zároveň mají během výstavby tunelů navazujícího úseku lokalitou Veleslavín – Ruzyně jezdit nákladní vlaky s odváženou rubaninou.
Nebyl posouzen hluk ze silniční dopravy u nového dopravního řešení v uzlu ulice Libocká a přeložky U Prioru, přitom nově navrženou a světelně signalizovanou křižovatkou Libocká x U Prioru má projíždět 18 tisíc vozidel denně.
Podle spolku by nedostatky řešila úprava z povrchové varianty na variantu zahloubenou.